Развёртывание программного обеспечения - достаточно сложный процесс, чтобы заморачиваться с ним самостоятельно. Посмотрите список инструментов в статье по ссылке, которые профессионально занимаются данным вопросом. Если речь идет только о Windows и разработка в среде Visual Studio, то подойдёт технология ClickOnce. Пример можно посмотреть, пройдя по ссылке в подписи этого сообщения.