Windows не относится к системам реального времени, как изветсно, поэтому работа с портом в таком режиме, э, непродуктивна
Быть может стоит пересмотреть протокол обмена ПК с контроллером на, например диалоговый или клиент-серверный, ибо постоянная передача (даже не периодическая какая-нить) смахивает на древний "контроль несущей"..
Я понимаю, что есть случаи, когда оно выгоднее, но винда для этого не приспособлена..
Ещё вариант - использовать звуковуху или простой "железный" геренатор

P.S. Мы опять увязаем в непонимание (скорее даже незнание) задач - как стратегической, так и тактической