Да не получается он при дампировании.
При дампировании получается то, что записано в таблицу.
Записал NULL (код #00) - получил NULL
Записал ' получил пустую строку не помню, помоему код FF
Перед дампированием нужно делать VACUUM, А вот rowid - нумерация строк и изменять её нельзя.
Образно говоря таблица БД - это пронумерованная (и прошнурованная) книга - вырвал листок (VACUUM), номер страницы выпал и перенумеровывать страницы - это уже подделка документа.
Только переписав в чистую, пронумерованную тетрадь получишь желаемый результат , что свободно можно сделать и с таблицей БД если программа, её использующая, не завязана на id и предварительно сделав что-то вроде
а не переносить из конца руками