такая проблема встречалась в прошлых версиях svn в различных сборках после обрыва связи или закрытии программы во время загрузки файлов...
Решилась установкой сборки CollabNetSubversion версии 1.7.1-1...
После установки этой версии, тестировал около часа обрывами, закрытием программы но после повторного запуска, клиент без вопросов продолжал грузить файлы с прерванной позиции...
------------ Дoбавленo в 21.10:
только что попробовал, на основной ОС и тестовых 2 ОС, все 3 обновились без проблем...
но в случае возникновения этой ошибки, поможет только удаление базы svn... больше решений я пока не нашёл.
------------ Дoбавленo в 21.18:

Так-же буду признателен если подскажете альтернативный консольный клиент
Вчера кучу статей/форумов перелопатил и в итоге выяснил что многие клиенты используют opensource движок SubVersion Apache, а других консольных альтернатив я не нашёл...
------------ Дoбавленo в 21.57:
Только что заметил что это предупреждение так же появляется после изменения расположения папки Elements или самой базы .svn.
Вы сборку/папку/базу не переносили?