Neo, вообще-то он Вам предложил именно такой вариант, начните с PRAGMA synchronous=OFF, это отключит ожидание записи на диск. SQLite по умолчанию может до двух мегабайт данных буферизировать в память, ожидая пока диск запишет предыдущую порцию. И этот буфер можно увеличивать.