БД тоже стандартизированы, по крайней мере, запросы к ним
Преимущесто БД -- она идет одним файлом, а не кучей файлов

ИМХО. Самый лучщий вариант -- применение БД на основе быстрых движков, и нафиг никакие XML не нужны. В одной базе можно хранить все, и бинарные данные -- тоже