сравнение .Net и Mono
много приложений используют WinApi -> выкинули
все остальные используют WinForms -> если приложение сложнее блокнота, тоже выкидываем, поскольку в Mono не реализованы нормально формочки, и приложение заваливается в эксепшенах при запуске.
остаётся только консольный софт не использующий вставок на других языках.

Mono также отсутствует в нормальном виде для BSD и Solaris (там есть так называемый порт-порта)

Вывод, кроссплатформенный софт, и то только между Lin-Win можно написать только с использованием Mono, т.к. написанное на Mono хотябы запускается под .Net(а в обратную сторону уже врятли).