У меня сделано так:
при запуске, программа скачивает с моего сайта маленький файлик, в котором записана последняя версия программы и ссылка на закачку.
считывает версию из этого файлика и сравнивает с текущей версией программы: если версия из файла выше текущей - скачиваем файл по ссылочке, иначе - ничего не делаем....