Выполните в HiSvn2 - Инструменты -> Отменить все изменения рабочей копии.
После этого действия, ещё рекомендуется пересобрать make и базы, но не обязательно.
После отмены, все SVN файлы рабочей копии, будут соответствовать SVN версии на 100%.
Все сторонние файлы (установленные элементы), которые отсутствуют на SVN, также останутся в рабочей копии.