konsys, попробуйте, здесь схема, ЕХЕ и пара элементов, которых у вас может и не быть.
https://forum.hiasm.com/getfile/39223
Ваш 3ВX-КД-пример.txt из ~133500 строк -- входной график и график разложения Фурье мой компьютер (Win10, 4 ядра, 3.2 ГГц) строит 15 сек, график корреляции по всем точкам 45 сек.
На второй пример из 2880000 строк терпения у меня не хватило