Clarc, возможно дело не в "какой то модификаций" а в настройках IE.
Возможно Вы или сторонние программы изменили настройки IE и был включен параметр "Использовать прокси-сервер для подключений" а также возможно была задействована ф-я IE "Работать автономно" что могло привести к "ДАк раньше качал и вдруг, перестал качать" т.к. используется движок IE...