Именно поэтому нужно переходить на пакеты, которые позволяют делать приложения под ОС любой разрядности. Поскольку 32х битные программы, работающие в 64 битной Windows теряют в производительности из-за эмуляции 32х битного окружения, то такой режим работы эквивалентен скажем потерям производительности гостевой ОС, запущенной под гипервизором XEN. Microsoft кстате говоря тактично не упомянуло об этой замечательной особенности использования каши из программ различной разрядности.

Поэтому советую не заниматься извращениями и ставить на ОС приложения той разрядности, которую она поддерживает (если это возможно)