Не хранятся там пароли, убрали их оттуда уже давно, в реестре они хранятся. Настройки можно сохранять отдельно, видимо, до кнопок Экспорт и Импорт руки не дошли.

Не нравится HiUpdate, могу предложить личную разработку -- VHiUpdate, там можно выбрать, что грузить надо. hiasm.db очень редко обновляется, кроме того, VHiUpdate создает резервные копии. Если понадобится, то находится в Публикаторе (Список проектов)
------------ Дoбавленo в 12.14:

Еще раз повторю -- не сидит пароль в базе в последних версиях и не будет больше сидеть