А я вам и не предлагаю вручную писать батники, и запускать их.
К примеру вы один раз записали все необходимые команды, далее в проге отмечаете нужные чекбоксы и прога сама делает батник с нужными командами и запускает его, после выполнения всех команд батник самоудаляется. Чем не лаунчер?