это не глюк, а старая фича


Если таймер не зарегистрировать (например, при инициализации библиотеки), то он, естественно, работать не будет. Кроме того, таймеры бывают разные, скажем, очередь сообщений, на которой работает тот же местный Timer, (в оконных приложениях) обычно обрабатывается оконной процедурой формы. Если речь о dll местного изготовления, то не стоит писать в тему по CallDllEx, ориентированному по большей части на сторонние библиотеки. Это не проблема компонента, это специфика местных библиотек.