Ясно, что-то подобное паттерновому трекеру. У Вас древовидная структура, многомерным массивом называть несколько не корректно. Базы данных в ОЗУ дадут вполне приемлимую скорость ибо в ряд ли у Вас секвенции (а именно на их уровне можно обращаться к БД, храня либо многострочные записи, либо строки с разделителем - их содержимое) чаще 14 такта считываются.