Может быть что-то другое, что меняет ядро под свои нужды. Вот почему я и спрашивал про одинаковые процессы на разных машинах. Надо попытаться найти эти одинаковые процессы и попробовать повырубать их, либо на этапе загрузки, либо в процессе работы. Соответственно, проверяя работу своего приложения.