andr_larr, во время отладки приложение сознательно "подвисает", передавая управление среде, естественно, на этот период отлаживаемое приложение не выполняет никаких действий, в том числе - не отрисовывает ничего на своих окнах. Если окно конструктора развёрнуто во весь экран, естественно, оно получает фокус и перекрывает окно отлаживаемой программы. Что конкретно Вы хотели от окна Debug? Редактирование данных посреди отладки штатно не предусматривалось. Глобальные переменные с точки зрения пользователя отличаются по именам.