Можно сделать в виде "матрешки". Т.е. ваша программа будет в себе содержать саму себя и при нажатии "сохранить" она будет сохранять свою копию и дописывать в нее требуемую информацию. Считывание этой информации с определенного места должно быть реализовано за ранее.
Вам может помочь этот материал:
http://hi-asm.blogspot.ru/2010/08/blog-post.html

При желании можно добавить в программу функцию ее закрытия после сохранения и удаления устаревшей копии программы.