Во-первых, здесь как раз вариант "второй гораздо больше". Во-вторых, "стрельба" по точкам одинаковая для каждого тестируемого, следовательно, можно просто один раз ее вычислить и вычесть (результат от этого не сильно изменится, как была разница в разы, так и останется).

Это тогда надо строить дерево выражения, как я понимаю. Если подскажешь метод, как обойтись без него и не переделывать парсер снова, то можно добавить.
А вообще если подумать, а надо оно в MathParse? Как никак FastMathParse никуда не девается, и для особо критичных вычислений остается он.