Блин, опять Благородные Доны отмалчиваются...
Уже все можно было сделать, протестировать, и рассказать про обнаруженные "несовместимости".
Или про их необнаружение (в практических схемах).

Предлагается изменить систему приоритетов для операторов в соответствии с вышеизложенным.
Добавить мимоходом 6 побитовых операций, и выкинуть к чертовой матери унарный минус (и, как следствие, костыль в сканере).
((Логика <= Лог.отрицание <= Сравнение <= Сложение <= Умножение <= Степень <= Бин.Логика <= Бин.Инверсия))
Делов, блин - на вечер. С крайне малой вероятностью глюков. Крайне малой.

Вопросы эти считаю едиными, как для штатного MathParse, так и для Ex-а.
И для штатного, их уже давно можно было закрыть

А Вы молчите. Неужели нравится, что (- X^2 + Y^2) считается как сумма квадратов.