На счёт иконок в Paint.NET там не зависит от версии программы , эта опция устанавливается отдельно
с помощью плагина , скачиваеш архив с длл-кой , и эту длл кидаеш в папку "FileTypes" в каталоге Paint.NET
в Program Files , и потом когда редактируеш рисунок в формате пнг , нажимаеш кнопку "Сохранить как" и у тебя
в типах файлов появится строка Icons(*.ico) , я для теста установил на виртуальной машине ХР-шку
с 512 мб памяти и одним процессором - всё работает:
http://prntscr.com/bsephb

вот тут про этот плагин и где скачать - http://paint-net.ru/forum/viewtopic.php?t=63

а тут видео - https://www.youtube.com/watch?v=9sFFjbjK73w

Так то удобнее будет - нарисовал в паинте и сразу сохранил как иконку , и ненада вторую прогу для иконок ...