amateur, извиняюсь.
С самой сути вопроса сбил именно сам вопрос.
События мыши (MouseEvent), координаты экрана и т.д. исчисляются именно в пикселях, отсюда и посчитал вопрос абсурдным.
Теоретически программно можно высчитать, зная скорость и время можно получить расстояние, но виндоус все равно таких значений не поймет (если ей нужно будет их передавать) и в лучшем случае они будут просто округлены до целого пикселя.