К сожалению, со средой такое бывает. Что потом и не вспомнишь, "чего нажимал"...
Среда начинает искать какие-то данные не-пойми-где с не-пойми-каким результатом.

Давным давно, мне хватало резервирования (в отдельном архиве) Panels.ini и Settings.cfg.
Сейчас может и еще какие-нибудь файлы надо резервировать (типа *.db).

Может коллеги и подскажут конкретно какие это файлы (их тех, что среда сама изменяет в процессе работы)
Лично я, специально этим вопросом не занимался...