Если используете FFT, то в результате Вы получите комплексную спектральную плотность.
Если вам нужен многополосный измеритель уровня, то никакой фурье не нужен, нужны полосовые фильтры, которые будут тупо делить сигнал на частотные полосы.
Надо IC писать.