Преимущества:
  - единственный источник установки программы (не надо искать другие ссылки в интернете);
  - гарантированное отсутствие вирусов в файлах (нет заинтересованности в подобных действиях);
  - автоматические обновление приложения (скачиваются только обновлённые файлы);

В свою очередь могу спросить: чем не устраивает такая форма развёртывания приложения?