Как один из выходов - экспортировать таблицы в CSV, АкелПадом конвертнуть полученные CSV, импортировать данные назад с очисткой перед импортом.
Тогда останется 1 вопрос - как правильно вносить\читать в\из БД.
Был бы благодарен за пример таких участков кода.