А виндовый клиент в эти пути?
Кроме того, может кодировка там не UTF-8, а какая-то другая (типа KOI-8 или не-кириллическая). Посмотри в настройках FTP-сервера и самой ОС. Посмотри логи клиента FileZilla - возвращает ли сервер название кодировки.