Есть два списка строк. В одном хранится данные о блоке в формате(x, y, ширина, высота, цвет, текст), а во втором данные о связях между блоками в форматеиндекс блока начала связи, индекс блока конца связи).
Сохранить эти два списка можно как в обычный текстовой файл, так и в ini файл.