AlexKir,
Есть такие программы (вернее учетные записи в них) - они привязаны к USB ключу.
кроме того есть понятие "избыточность защиты" - если кратко, то это комбинация нескольких способов защиты (и навесные, и внутренние, а также привязка к компьютеру).