Ты хочешь сказать, что у тебя, при интрвале <20 мсек и длине считывания буфера 18 байт (кстати, а у тебя сколько стоит), не появляются пустые символы, такого быть не может. При считывании буфера FIFO, автоматически происходит его уменьшение на количество считанных байт, и если их только 18, и считываем их только 18, то в буфере FIFO будет 0, до следующей посылки.
Ты можешь дать последовательность твоего устройства, записей, этак, на 100, ну на крайняк -- 50, естественно, разных. Специально врублю виртуалку, сделаю эмулятор посылок и проверю, но вечером, дома. Если тебе, конечно, это очень интересно и нужна моя помощь. Можешь еще и схемку прицепить, что бы меньше возни было