Так тоже пробовал.
Если вместо "Print" подставить элемент Message то при запуске не появляется сообщение.
Я так понимаю при запуске консоль запускает программу через WinExec и не дожидаясь её завершения сама закрывается.
Не помогает установка параметра RunEvent в Wait
------------ Дoбавленo в 03.53:
Порядок программы такой:

1.прочитать параметры переданные при запуске
2.скопировать один файл
3.прочитать параметры из *.ini файла
4.сгенерировать файл make
5.запустить компилятор
6.дождаться завершения работы компилятора
7.скопировать файл
8.удалить все лишние файлы
9.закрыть консоль