Не скажу как под другими ОС, но под Windows XP сделать по нормальному не получится, т.к. она не позволяет размещать один и тот же объект в разных каталогах или напрямую использовать относительные ссылки.
Программы-каталогизаторы для этого есть, но все они имеют существенные недостатки.
Категории лучше придумай сам, иначе через неделю не вспомнишь, что в какой лежит.