А отдельный процесс-менеджер нельзя написать? Который бы управлял остальными модулями и перераспределял потоки данных между ними, в зависимости от списка загруженных модулей и настроек. По моему это более эффективный путь.
Общение можно осуществить через общую память. Сам не пробовал, но о таком способе слышал. По моему это часть технологии отображения файлов в память. Только вот не знаю, попадет ли общая память на диск или нет. Если попадет - это было бы заметной нагрузкой на диск и замедлением коммуникаций модулей приложений. Хотя, если откэшируется - тогда все отлично.