У компонента WinExec есть точка ProcessID. После каждого запуска программы добавляешь её ProcessID в список. Для закрытия программы пробегаешься по списку и закрываешь с помощью компонента EnumProcess. Только такой способ закрытия не очень корректный, можно пробовать для каждого процесса искать главное окно (или все) и посылать им команду закрытия.