Проблема не ушла полностью. Периодически продолжается загрузка процессора, хотя теперь и меньше обычного. Пробовал в поток отдельный вынести для эксперимента - не помогло. Ставил интервал таймера в секунду - совсем без разницы. За то если разорвать выход на прозрачность формы, то процессор не грузит, хотя логику всю выполняет ведь как раньше.