Netspirit, пробовал сначала и через local machine. Потом current user. Эффект тот же. Похоже не зависит от ветки, тк даже с автозапуском через ярлык все равно ругалось о записи в реестр, нашел причину - там схема привязки расширений к программе опять же состояла из элементов реестра.
Помню как то раньше я делал мод компонента реестра чтобы в свойствах можно было отключать это сообщение об ошибке. Теперь уже неинайду наверное.