А зачем? Честное слово первый раз с таким сталкиваюсь. Вот сколько уже лет с компами, ни разу в жизни не понадобилась такая ерунда. Предположим мы "склеим" 1.exe и 2.exe. Последовательность их запуска будет такая же? т.е. сначала 1, а потом 2? Если так, то зачем тогда склеивать? Пусть живут оба. а третий файл 3.exe по коду Вячеслава пусть их прекрасно запускает.

Можно еще вот так, создать файл 3.cmd, или 3.bat на диске: