увы, не могу 100% описать повторение, но заметил, что иногда при наличии довольно длинного лога (если ошибок много например) не происходит прокрутки в конец. длинные логи у fpc часто бывают, а уж 50 ошибок по умолчанию вообще такие простыни выдают. но и при исползовании компилятора delphi такое тоже происходит, даже при 10-20 строках.
грешить на использование wine, или у кого и в родной системе такое было?

и еще. если есть 5-6 открытых вкладок, то при закрытии какой-нибудь посередине не всегда их кол-во уменьшается. окно проекта закрывается, отображается находящаяся левее вкладка, а список самих вкладок не обновляется что-ли, пока мышью туда не щелкнешь. вот такое встретил на 2000-ой, были открыты 2 проекта и 3 вкладки по ctrl-f.

p.s.
пожелание к самой среде.

хотелось бы в будущем увидеть настройку ширины линий, а то на больших мониторах уж очень всматриваться приходится. ctrl-m конечно спасает, но линии остаются тонкими. мне лично приходится юзать аналог виндовой лупы, типа отдельное окно, которое отображает увеличенный участок находящийся под курсором.

и еще. выбор цвета фона и тех же линий в окне проекта имхо не помешал бы.