user_asm, Уверены, что кодировка полученного файла -Windows (cp1251) У меня коммандер 7.56, Wincmd.ini в кодировке cp1251, конец строки 0x0d, 0x0a. Прекрасно всё работало на Win7 x86, WinXPSP3, Win TabletPC 2005 (аналог XPSP3).

Перепроверьте, если локаль системы сбилась с русского, то будет вылезать такая проблема. Правильная локаль устанавливается в Языках и региональных настройках. Если там стоит русский, это ещё не значит, что он включен. Надо скинуть на английский, перегрузиться, и вернуть русский опять. Вариант - такой вот файл реестра применить:
code_24028.txt

P.S.: Хорошие заменители блокнота типа AkelPad умеют принудительно сохранять в любой кодировке с любым концом новых строк, не зависимо от настроек системы.